Charakteristiky firmy, morfologie a klasifikace

1804
Jonah Lester

Firmicutes Je to jeden z kmenů, ve kterém jsou bakterie klasifikovány. Tento kmen zahrnuje tři třídy (Bacilli, Clostridia a Erysipelotrichia), 26 rodin a 223 rodů, čímž tvoří hlavní bakteriální kmen.

Bakterie klasifikované v tomto kmeni mají společnou evoluční historii. Všechny mají pevnou buněčnou stěnu, od níž je odvozen název Firmicutes (v latině firmus  znamená pevné a kůže viz kůže nebo buněčné stěny). 

Lactobacillus acidophilus. Doc. RNDr. Josef Reischig, CSc. (Archiv autora) [CC BY-SA 3.0 (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/3.0)], prostřednictvím Wikimedia Commons

Všechny kmenové bakterie obsahují kyselinu muramovou v buněčné stěně a některé obsahují kyselinu teitoovou. Většina z nich je grampozitivní, kromě čeledí Veillonellaceae a Syntrophomonadaceae, které jsou gramnegativní..

Bakterie Firmicutes jsou fenotypicky rozmanité a mohou to být sférické, rovné, zakřivené buňky, spirálové tyče nebo filamenty, s bičíky nebo bez nich, s nebo bez tepelně odolných endospór..

Mohou být aerobní, fakultativní nebo přísně anaerobní. Některé jsou teplomilné a / nebo halofilní. Některé z nich jsou chemoorganotrofy a jiné anoxické fotoheterotrofy. Většina roste v neutrálním pH, ale některé jsou acidofilní nebo alkalifilní. Mají obsah DNA, který je obecně nižší než 50%.

Bakterie zařazené do kmene Firmicutes tvoří důležitou součást lidské střevní flóry spolu s bakteriemi zařazenými do kmene Bacteriodetes. Nedávné studie zjistily, že střevní mikrobiota obézních lidí a zvířecích modelů je spojena s větším množstvím Firmicutes ve vztahu k Bacteriodetes..

Rejstřík článků

  • 1 Obecná charakteristika
    • 1.1 Fylogeneze
  • 2 Klasifikace
    • 2.1 Třída Clostridia
    • 2.2 třída Erysipelotrichia
    • 2.3 Třída Basilli
  • 3 Gastrointestinální mikrobiota
  • 4 Odkazy 

Obecná charakteristika

Fylogeneze

Fylogeneze Firmicutes byla neustále revidována a znovu studována, zahrnující stále více dat a nových metod, které umožňují navrhovat nové evoluční hypotézy..

Nedávné studie založené na analýze malých podjednotek nukleosidových sekvencí ribozomální RNA vytvořily fylogenetický rámec, ve kterém je kmen Firmicutes tvořen třemi třídami (Basilli, Clostridia a Erysipelotrichia), 26 rodin a 223 rodů..

V předchozích klasifikacích tento kmen obsahoval další třídu zvanou Mollicutes, která se liší od ostatních bakterií Firmicutes tím, že postrádá pevné buněčné stěny, postrádá peptidoglykany nebo kyselinu muramovou, je flexibilní a je vysoce pleomorfní..

Tato skupina byla odstraněna z Firmicutes v novějších studiích s alternativními markery. Výsledkem bylo, že třída Mollicutes byla povýšena na okraj Tenericute.

Rodina Erysipelotrichaceae, dříve klasifikovaná jako Mollicutes, která tvoří grampozitivní buněčnou stěnu, zůstává ve Firmicutes jako nová třída zvaná Erysipelotrichia s jediným řádem (Erysipelotrichales), který zahrnuje jednu rodinu (Erysipelotrichaceae). Nedávné analýzy potvrzují oddělení tříd Basilli a Clostridia.

Klasifikace

Třída Clostridia

Třída Clostridia je fenotypicky, fyziologicky a ekologicky rozmanitá polyphyletická clade. Obsahuje grampozitivní i gramnegativní bakterie a většina rodů tvoří spory, až na výjimky jako např Clostridium.

Třída Clostridia se skládá z řádů Clostridiales, Halanaerobiales a Thermoanaerobacterales. Bakterie patřící do řádu Clostridiales jsou přísní anaeroby, bakterie řádu Halanaerobiales halofilní a bakterie řádu Thermoanaerobacteriales termofilní.

Některé druhy Clostridia mají pro průmysl velký význam, protože se používají k výrobě rozpouštědel jako konečného produktu fermentačního procesu.. 

Jiné produkují toxiny, jako např Clostridium botulinum, také známý jako BoTox, k paralýze svalů obličeje ke snížení vrásek na pokožce.

Erysipelotrichia třída

Tato třída je složena z bakterií ve tvaru jemných tenkých, rovných nebo mírně zakřivených tyčinek se sklonem k tvorbě dlouhých vláken. Jsou nepohybliví s grampozitivní buněčnou stěnou, která neprodukují endospory.

Jsou aerobní, fakultativně anaerobní. Jsou chemoorganotropní. Mají fermentační respirační metabolismus. Tato skupina zahrnuje některé druhy, které jsou patogenní pro savce a ptáky, včetně Erysipelothrix rhusiopathiae Y Bulleidia extrudovaný.

Třída Basilli

Bakterie třídy Basilli obecně tvoří grampozitivní buněčnou stěnu. Mohou nebo nemusí vytvářet endospory. Většina z nich je aerobních nebo mikroaerofilních, zatímco jen několik z nich je fakultativně anaerobních. Třída Bacilli se skládá z objednávek Bacillales a Lactobacillales.

Většina rodů řádu Bacillales tvoří endospory, i když existují výjimky. Kromě toho mají grampozitivní barvení buněčné stěny v mladých buňkách. Většina rodů má menachinon 7 (MK-7).

Menychinony s dlouhým řetězcem, od MK-6 do MK-11, byly hlášeny v rodině thermoactinomycetaceae. Menachinony jsou také známé jako vitamin K.dva

Počet vedlejších řetězců je uveden v konkrétním názvu každého menachinonu (např. MK-6 má šest molekulárních jednotek připojených k jádru molekuly tvořených chinonovým kruhem).

Rod bacillales zahrnuje vysoce patogenní bakterie, jako jsou Bacillus anthracis, způsobující antrax. Dalším důležitým druhem je Bacillus subtilis, jeden z organismů používaný jako model ve výzkumu k pochopení témat od buněčné diferenciace po skladování železa a replikaci DNA.

Bakterie řádu Lactobacillales mohou mít tvar tyčinky nebo koksu, mohou mít grampozitivní barvení buněčné stěny, netvoří endospory, jsou fakultativními anaeroby a jsou většinou negativní na katalázu..

Tato objednávka zahrnuje prospěšné bakterie, jako jsou Lactobacillus, důležité složky gastrointestinální flóry u lidí a jiných zvířat, a používá se řemeslně a průmyslově k výrobě jogurtu a jiných fermentovaných potravin.

Gastrointestinální mikrobiota

Mikrobiota gastrointestinálního traktu hraje důležitou roli při udržování lidského zdraví tím, že poskytuje energii, živiny a imunitní ochranu. U zdravých dospělých jedinců bylo identifikováno více než 1250 druhů bakterií patřících hlavně do kmenů Bacteroidetes, Firmicutes a Actinobacteria..

Obecně je vztah Firmicutes / Bacteroidetes považován za velmi důležitý ve složení lidské střevní mikrobioty. U obézních lidí byl zjištěn vysoký podíl Firmicutes, zatímco u osob s nízkou hmotností byl hlášen inverzní vztah.

Složení této mikrobioty se vyvíjí po celý život, od raného dětství až po stáří. Poměr Firmicutes / Bacteroidetes se tak zvyšuje od narození do dospělosti a je dále pozměňován s pokročilým věkem..

Bylo také zjištěno, že dieta má významný vliv na gastrointestinální mikroflóru. Poměr Firmicutes / Bacteroidetes je vyšší u lidí s dietou založenou na živočišných bílkovinách a nasycených tucích než u lidí s dietou s vysokým obsahem zeleniny a vlákniny..

Reference

  1. Bahl, H & Dürre, P. (2000). Clostridia: Biotechnologie a lékařské aplikace. Německo. Wiley-VCH.
  2. Conlon, M.A. & a Bird. A.R. (2015). Dopad stravy a životního stylu na střevní mikroflóru a lidské zdraví. Živiny, 7 (1), 17-44.
  3. Firmicutes. (2018, 30. ledna). Wikipedia, The Free Encyclopedia. Datum konzultace: 20:40, 27. září 2018 z es.wikipedia.org
  4. Firmicutes. (2018, 17. září) V Wikipedia, The Free Encyclopedia. Citováno 20:41, 27. září 2018, z en.wikipedia.org
  5. Mariat, D, Firmesse, O., Levenez, F, Guimarăes, VD, Sokol, H, Doré, J, Corthier, G a Furet JP. (2009). Poměr Firmicutes / Bacteroidetes lidské mikrobioty se mění s věkem. Mikrobiologie BMC, 9: 123.
  6. Vos, P., Garrity, G., Jones, D., Krieg, N.R., Ludwig, W., Rainey, F.A., Schleifer, K.-H., Whitman, W. (2009). Bergey's Manual of Systematic Bacteriology: Volume 3: The Firmicutes. POUŽITÍ.

Zatím žádné komentáře